本作は味方ユニットの数が母艦を除いて最大10機の制限があるために、説得して味方にしてもすぐに離脱してしまうケースが非常に多い。

隠し要素

ゲッターQ早乙女ミチル

第2話「謀略の町」において、敵として登場するゲッターQを3EPまで撃墜せずにおくと、4PPでNPCとして自軍に参入。

エルメスララァ

第3話「ダカールの制圧」において、アムロでララァを説得すると自軍に加入するが、第7話「決闘!!ラインX1」クリア後に離脱する。

メカ胡蝶鬼胡蝶鬼

第6話「敵要塞を破壊せよ!」において、メカ胡蝶鬼のHPが200以下の状態で竜馬で胡蝶鬼を説得すると自軍に加入するが、第8話「マ・クベの罠」クリア後に離脱する。

ミネルバX

第8話「マ・クベの罠」において、甲児でミネルバXを説得すると自軍に加入するが、第9話「復讐の風」クリア後に離脱する。

サイコガンダムフォウ

第10話「マリオネット・フォウ」において、カミーユでフォウを説得すると自軍に加入するが、第13話「シロッコの影」クリア後に離脱する。

キュベレイMk-IIプル

  1. 第13話「シロッコの影」において、ジュドーでプルを説得する。
  2. 第17話「ソーラレイ発動」において、ジュドーでプルを2回説得すると、自軍に加入する。

クィン・マンサ

FC版:プルが自軍にいる状態で第24話「ギルギルガンの亡霊」をクリアすると、プルがキュベレイMk-IIからクィン・マンサに乗り換える。

CB版:第24話「ギルギルガンの亡霊」でプルが(36,16)の町に待機。クリア後入手。FC版と違いキュベレイMk-IIはなくならない。

サイコガンダムMk-IIプルツー

  1. 第19話「月面の死闘」において、プルツーがプルを撃墜する(この時点でプルは死亡)。
  2. 第22話「大気圏突入」において、ジュドーでプルツーを説得すると、自軍に加入する。

ビギナ・ギナセシリー

  1. 第16話「脱出」において、シーブックでセシリーを説得する。
  2. その後、セシリーを撃墜せずに同マップクリア(CB版のみ)
  3. 第25話「ラストバタリオン再び」において、シーブックでセシリーを説得すると、NPCとして自軍に加入する。

CB版では脱出でセシリーを説得も撃墜もせず、ラストバタリオン再びでシーブックでセシリーを2回説得した場合も加入。