第2次ネオ・ジオン抗争（Second Neo-Zeon Conflict）とは、『機動戦士ガンダム 逆襲のシャア』の舞台となった戦争。
概要
宇宙世紀0093年に勃発した地球連邦軍とシャア・アズナブル率いるネオ・ジオン軍との戦争で、「シャアの反乱」とも呼称する。
ネオ・ジオン軍は難民用コロニー｢スウィートウォーター｣を占拠して地球連邦政府に宣戦を布告。小惑星5thルナを当時の地球連邦軍の本部だったラサに落下、壊滅させる。ロンデニオンにおける会談ではネオ・ジオンへのアクシズ譲渡で和平交渉を成立させたかにみえたが、その後、ネオ・ジオン軍はルナツーを急襲して核を奪取。アースノイドを粛清するべくアクシズの地球への落下による｢地球寒冷化作戦｣を実行に移す。
ロンド・ベル隊の活躍によってネオ・ジオン軍は撃退されるものの、アクシズの地球落下は不可避の状況に陥ってしまう。この時、νガンダムに搭乗するアムロ・レイを筆頭に、両軍のモビルスーツパイロットが地球滅亡を食い止めるべくアクシズに取りつき、最後はνガンダムに内蔵されたサイコフレームの共振によってアクシズは地球圏内を離れ、第2次ネオ・ジオン抗争は終結する。そして、この時にアムロとシャアの両名は行方不明となった…。
SRWでは『第2次スーパーロボット大戦α』が、最も第2次ネオ・ジオン抗争（『機動戦士ガンダム 逆襲のシャア』の物語）を再現している（ただし、原作の面子にほぼ忠実なのは『スーパーロボット大戦R』である）。
関連人物
その後の地球圏
アクシズ阻止時に起きた不可解な出来事は、一部の人間からは｢アクシズ・ショック」と称されている。以後のロンド・ベル隊はネオ・ジオン軍の残存勢力掃討にあたっていたが、宇宙世紀0096年、連邦政府の最高機密「ラプラスの箱」をめぐる事件が発生する。
宇宙世紀0100年。ジオン共和国の自治権は地球連邦政府に返還され、これによりジオン公国は事実上消滅。なお、宇宙世紀は100年以上になっても、同じ過ちは繰り返されるままであった。
宇宙世紀0105年。「マフティー・ナビーユ・エリン」を名乗る人物が、依然として高圧的な政策を取り続ける連邦政府への抵抗を試みる。しかし、地球連邦軍キルケー部隊によって逮捕、処刑された。この時にブライトは連邦軍から退役した。
宇宙世紀0120年代には、元ホワイトベースのクルーであるジョブ・ジョンがガンダムF90の開発に関わっている。また、宇宙世紀0120年から0122年の2年間、火星へと逃げ延びたジオン軍の残党がオールズモビル（火星独立ジオン軍）として連邦軍と対立したが、鎮圧された。