- 本作はDLCがあるため、隠し機体・隠しパイロットは存在しない。詳細はダウンロードコンテンツ/OEを参照
- レベル差補正があるためか特定ユニット撃墜関連のフラグは全てマップ上(戦艦内含む)に該当機体がいれば撃墜者は誰でもよい。
- 分岐がないため、追加武装関連は一度のプレイで全て入手可能。
隠し要素（追加武装）
ガンダムラストシューティング
5章 19話‐3「アクシズからの撤退」でホワイトベースの指定エリア到達前にジオングを撃墜する。
マジンガーZビッグバンパンチ（通常/突破）
5章 20話-1 「第203ワープゲート」の出撃選択でマジンガーZを選択。
2体目のギガ・ネクトンαα撃墜時までにマジンガーZが撃墜されていなければイベント発生。 ※出撃選択していれば、常に搭載したままでも可。
Ζガンダムウェイブライダー突撃
6章 23話-3 「地球圏統一」の出撃選択でZガンダムを選択。 クィン・マンサ撃墜時までにZガンダムが撃墜されていなければイベント発生。
キングスカッシャー 守護騎士 召喚
下記、各ミッションでキングスカッシャーを出撃選択で選び、ミッション中出現するコンテナをキングスカッシャーで回収。
その他
強化パーツ
特定ミッションを2回目以降のプレイ時、特定の機体を出撃させるとコンテナが追加される。 数が膨大な上、全てパーツ交換でも入手可能なため詳しくは省略。
山本春枝
隠し要素と言う訳ではないがゴウザウラーorキングゴウザウラーの戦闘シーンで発言しない限り、キャラクター閲覧に登録されない。