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第3作『[[スーパーロボット大戦EX]]』では、ゲーム独自の世界[[ラ・ギアス]]を舞台に、バンプレストオリジナルおよび版権作品のキャラクター、メカニックが共闘するという展開が繰り広げられた。マサキを始めとする[[魔装機神]]操者達とシュウが主人公として活躍、物語中では多数の[[魔装機]]およびその操者が初登場し、ラ・ギアスの世界観が初めて本格的に明かされた。これらの設定は好評を博し、多くのファンを生んだ。続編『[[第4次スーパーロボット大戦]]（[[第4次スーパーロボット大戦S|S]]）』にも魔装機神勢は引き続き参戦し、旧シリーズの物語は一旦終結した。

第3作『[[スーパーロボット大戦EX]]』では、ゲーム独自の世界[[ラ・ギアス]]を舞台に、バンプレストオリジナルおよび版権作品のキャラクター、メカニックが共闘するという展開が繰り広げられた。マサキを始めとする[[魔装機神]]操者達とシュウが主人公として活躍、物語中では多数の[[魔装機]]およびその操者が初登場し、ラ・ギアスの世界観が初めて本格的に明かされた。これらの設定は好評を博し、多くのファンを生んだ。続編『[[第4次スーパーロボット大戦]]（[[第4次スーパーロボット大戦S|S]]）』にも魔装機神勢は引き続き参戦し、旧シリーズの物語は一旦終結した。

その後、『EX』と同じくラ・ギアスを舞台にして旧シリーズの前日談および後日談を描いた作品『[[スーパーロボット大戦外伝 魔装機神 THE LORD OF ELEMENTAL]]』が制作された。本作では、後の『[[OGシリーズ]]』と同じく版権作品が一切登場せず、独自のキャラクター・メカニックのみが登場する物語が展開された。強い支持を得たこの作品により、『魔装機神』は独自作品としての地位を確立した。

その後、『EX』と同じくラ・ギアスを舞台にして旧シリーズの前日譚および後日譚を描いた作品『[[スーパーロボット大戦外伝 魔装機神 THE LORD OF ELEMENTAL]]』が制作された。本作では、後の『[[OGシリーズ]]』と同じく版権作品が一切登場せず、独自のキャラクター・メカニックのみが登場する物語が展開された。強い支持を得たこの作品により、『魔装機神』は独自作品としての地位を確立した。

=== 停滞期 ===

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