差分
→ルート分岐一覧
| 第1分岐 || 第9話（※）クリア後 || (1)：ジャブローへ向かう<br />(2)：南アタリア島へ向かう
| 第1分岐 || 第9話（※）クリア後 || (1)：ジャブローへ向かう<br />(2)：南アタリア島へ向かう
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| 第2分岐 || 第20話「決戦、第2新東京市」クリア後 || (1)：EVA弐号機輸送艦隊と合流する<br />(2)：極東地区に残る<br />(3)：リガ・ミリティアと接触し、宇宙へ行く
| 第2分岐 || 第20話「決戦、第2新東京市」クリア後 || (1)：リガ・ミリティアと接触し、宇宙へ行く<br />(2)：極東地区に残る<br />(3)：EVA弐号機輸送艦隊と合流する
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| 第3分岐 || 第29話（※）クリア後 || (1)：EVA2体による作戦を選ぶ<br />(2)：力押しで使徒を倒す作戦を選ぶ
| 第3分岐 || 第29話（※）クリア後 || (1)：EVA2体による作戦を選ぶ<br />(2)：力押しで使徒を倒す作戦を選ぶ