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→アルヴィス製ファフナー
:汎用格闘型。ライトグレー。[[日野道生]]の専用機。無印で損壊。
:汎用格闘型。ライトグレー。[[日野道生]]の専用機。無印で損壊。
;マークツヴァイ（Mk.II）
;マークツヴァイ（Mk.II）
:SRW未登場。接近戦仕様。黒。蔵前果林の専用機。本編では搭乗直前に蔵前が行方不明となり、マークエルフの修復パーツとなった。以降欠番。
:接近戦仕様。黒。蔵前果林の専用機。本編では搭乗直前に蔵前が行方不明となり、マークエルフの修復パーツとなった。以降欠番。
:SRW未登場だが、改修後のマークエルフはコアも含めてほぼ全部ツヴァイのパーツに入れ換わっているため実質マークツヴァイと言えなくもない。
;[[マークドライ]]（Mk.III）
;[[マークドライ]]（Mk.III）
:汎用格闘型。オレンジ。[[要咲良]]の専用機だったが、蒼穹作戦では[[カノン・メンフィス]]が搭乗する。
:汎用格闘型。オレンジ。[[要咲良]]の専用機だったが、蒼穹作戦では[[カノン・メンフィス]]が搭乗する。
:ライトグレー。里奈の双子の弟・[[西尾暉]]の専用機。マークアハトの同型機。ドラゴントゥース使用。無印では空席。
:ライトグレー。里奈の双子の弟・[[西尾暉]]の専用機。マークアハトの同型機。ドラゴントゥース使用。無印では空席。
;[[マークエルフ]]（Mk.XI）
;[[マークエルフ]]（Mk.XI）
:汎用格闘型。水色。[[真壁一騎]]の専用機。ツヴァイのパーツが流用されたため、カラーリングは2話にして変更。無印で人類軍に接収された後、行方不明。
:汎用格闘型。水色。[[真壁一騎]]の専用機。ツヴァイのパーツが流用されたため、カラーリングは2話にして変更。無印で人類軍に接収された後コアを[[マークザイン]]に移植される。コアを抜かれた本体はモルドヴァ基地の自爆に巻き込まれてロストしたと思われる。
:SRWではファフナー初参戦の『[[スーパーロボット大戦K|K]]』では改修後の姿のみだったが、『[[スーパーロボット大戦UX|UX]]』にて改修前の仕様も登場した。
;[[マークツヴォルフ]]（Mk.XII）
;[[マークツヴォルフ]]（Mk.XII）
:赤。[[立上芹]]の専用機で、マークドライの同型機。特殊すぎる装備『ショットガンホーン』を持つ。無印では空席。
:赤。[[立上芹]]の専用機で、マークドライの同型機。特殊すぎる装備『ショットガンホーン』を持つ。無印では空席。