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美琴の通う常盤台中学は絵に描いたようなお嬢様学校だが、本人の行動パターンは一般的な女子中学生のそれで、男勝りな性格もあってお嬢様らしさは余りない。もっとも、高級品を軽い買い物感覚で買う、着替えのためだけにホテルを借りるなど、金銭感覚は一般人とは掛け離れている。学業優秀・スポーツ万能で、人柄も竹を割ったような明るく快活な姉御肌で面倒見が良く、白井黒子を初め、多くの後輩たちから慕われている。当初はレベル1しか無かった自身の能力を努力によって現在の精度と出力にまで高めた努力家でもあり、名実共に「常盤台のエース」として学校内外にその勇名は鳴り響いている。また、正義感が強く悪者を見過ごせない性分のため、しょっちゅう犯罪者を現行犯拘束するなどの行動をしており、これもまたレベル5の中で美琴が特に目立つ一因となっている。スカートの下には常に体操着の短パンを穿いており、これが彼女のクローンであるシスターズと見分ける上での相違点となっており、ある意味最大の特徴ともなっている。
美琴の通う常盤台中学は絵に描いたようなお嬢様学校だが、本人の行動パターンは一般的な女子中学生のそれで、男勝りな性格もあってお嬢様らしさは余りない。もっとも、高級品を軽い買い物感覚で買う、着替えのためだけにホテルを借りるなど、金銭感覚は一般人とは掛け離れている。学業優秀・スポーツ万能で、人柄も竹を割ったような明るく快活な姉御肌で面倒見が良く、白井黒子を初め、多くの後輩たちから慕われている。当初はレベル1しか無かった自身の能力を努力によって現在の精度と出力にまで高めた努力家でもあり、名実共に「常盤台のエース」として学校内外にその勇名は鳴り響いている。また、正義感が強く悪者を見過ごせない性分のため、しょっちゅう犯罪者を現行犯拘束するなどの行動をしており、これもまたレベル5の中で美琴が特に目立つ一因となっている。スカートの下には常に体操着の短パンを穿いており、これが彼女のクローンであるシスターズと見分ける上での相違点となっており、ある意味最大の特徴ともなっている。
学園都市の能力者として開発を受ける過程で科学にも深く携わってきた経緯から、こと科学知識に関しては学者並みの博識振り。そのこともあってか魔術や心霊と言った非科学的なものは信じておらず、理解不能な事象もとりあえず科学に当てはめて考えようとする傾向が強い。その他の学業も総じて優秀であるが、美琴のような上位能力者は、脳内演算で能力を制御する術に長けていることが強さの秘訣の一つでもあるため、並行して知能にも優れている者が多い。一方で少女趣味的な嗜好を持つ一面があり、下着やパジャマ、ぬいぐるみのセンスなども親しい間柄の友人をして「子供っぽい」と評価された。この事は本人にも自覚があり、他人には悟られないようにしている。
ある時、自身の攻撃を手をかざすだけで打ち消して逃げた上条当麻にプライドを傷つけられたことにより、再戦のためにその行方を追う。それが美琴を取り巻く状況の変化を招く切っ掛けとなり、学園都市の暗部や魔術サイドとの抗争といった巨大な戦いと陰謀の渦中、そして自身の能力や秘密にまつわる事件にも深く関わっていくこととなる。
ある時、自身の攻撃を手をかざすだけで打ち消して逃げた上条当麻にプライドを傷つけられたことにより、再戦のためにその行方を追う。それが美琴を取り巻く状況の変化を招く切っ掛けとなり、学園都市の暗部や魔術サイドとの抗争といった巨大な戦いと陰謀の渦中、そして自身の能力や秘密にまつわる事件にも深く関わっていくこととなる。