マップ間に挟まれるデータ管理画面。
セーブ、ロード、ユニットや武器の改造、パイロット養成、小隊編成、乗り換え、強化パーツ交換、能力確認等が可能。一部シリーズではシナリオ開始後でも出撃準備としてインターミッションと同様のデータ管理が可能。
インターミッションで実行可能なコマンド
作品ごとに登場するコマンド項目や呼ばれ方には違いがある。
ユニット系
- ユニット能力
- 現在自軍に登録されている使用可能な機体（変形先含む）の一覧が表示され、能力を確認できる。現行作品では強制出撃ユニットも確認可能。
- ユニット改造
- ユニットの機体性能を改造する。
- 武器改造
- 『EX』から導入。武器の攻撃力を上げる。MXでは命中率とクリティカル率も改造可能。
- 導入当初は各武器ごとの個別改造方式であったが、α外伝で一括採用方式を初採用、以降一部作品を除き標準化されている。
- 強化パーツ
- 入手した強化パーツを付け替える。強化パーツが廃止されたL・UXには登場しない。
- ユニット捨てる
- 『第3次』より登場。ユニットを下取りに出す。
- 合体・変形・分離
- 初期の作品のみ登場。各機1形態のみ表示される作品で能力確認、改造、強化パーツ付け替えのために形態を変える。全形態表示されるようになるとともに廃止された。
- 換装
- 『α』より登場。一部機体に設定された専用換装パーツを付け替える。
- 武器選択
- OGシリーズ全般に登場。換装武器の着脱を行う。
- 特殊弾
- OGS・OG外伝に登場。特殊弾素材を組み合わせて武器能力を変化させる特殊弾を開発したり、開発済みの特殊弾を素材に戻す。特殊弾を装填可能なのは、換装武器の実弾系銃器のみ。
パイロット系
- パイロット能力
- 現在自軍に登録されている使用可能なパイロットの一覧が表示され、能力を確認できる。現行作品では、強制出撃パイロットも確認可能。
- 乗り換え（のせかえ）
- パイロットやサブパイロットを別の機体に乗せる。乗せ換えられるパイロットと機体は作品ごとに決まっている。
- パイロット養成
- OG1以降の作品で登場。戦闘で得たPP（パイロットポイント）を消費してパイロットの能力値を上げたり、特殊技能を追加する。D・J・Wではレベルアップで得られるBP（ボーナスポイント）を消費して能力値を上げる。
- スキルパーツ
- D以降の携帯機シリーズ作品・GC / XO・A PORTABLEに存在。XO以前ではパイロットのスキルパーツの付け替え。W以降はスキルパーツを消費してパイロットに特殊技能を修得させたり、BPの獲得を行う。
- サブオーダー
- 第2次Z・第3次Zに登場。直前のマップにおいて未出撃であったパイロットに対し各オーダーを行う事で、経験値や資金などを入手できる。
- 戦術指揮
- UXに登場。戦術指揮を行うパイロットの設定・変更が可能。
小隊系
- 小隊編成 / PU（ユニット）編成 / 部隊編成 / チーム編成
- 第2次α・第3次α・Z・K以降の携帯機シリーズなど、小隊系システム採用作品に登場。小隊編成や、小隊名の変更などを行う。編成は手動の他、第3次αとZでは自動編成も可能。次のマップの強制出撃ユニットも確認できる。
- OGs・OG外伝のツインユニットは現地合流タイプのため編成メニューは存在しなかったが、インターミッション編成が可能になった第2次OGにて「部隊編成」の名称で登場。
- 第3次Zでは「チーム編成」の名称で登場。
システム系
- セーブ
- ゲームデータを記録する。
- ロード
- ゲームデータを呼び出す。主に、改造やパイロット養成などが納得いかなかった場合や、シナリオやルートを遡る際に行う。当然ながら、変更前のデータを予め保存していることが必要。
- セーブのみでロードができない作品もある。
- ライブラリ
- ロボット大図鑑やキャラクター辞典といったゲーム内データを閲覧可能。
- 検索
- 特定の精神コマンド・特殊技能・特殊能力・小隊長能力・特殊武器の所持パイロットやユニットを探し出す。
- バザー
- 『戦闘メカ ザブングル』が参戦しているスーパーロボット大戦α外伝・スーパーロボット大戦Zに登場。専用通貨のブルーストーン（BS）でユニットや強化パーツ、アイテムの売買ができる。シナリオによっては登場しない。
- Dトレーダー
- 第3次Zに登場。専用通貨のZチップで強化パーツやアイテムの売買（条件を満たせばユニットも購入可能）ができる。詳しくはリンク先参照。
- ショップ / トレードショップ
- D以降の一部作品で登場。強化パーツやスキルパーツを売却可能。GC・XOでは運用した捕獲ユニットを売却したり、強化パーツに変換もできる。捕獲ユニットは撃墜時の2倍の金額で売却でき、改造額が全て還元。なお、Wでは2周目以降に資金で強化パーツやユニットの購入が可能。
- トレードショップはOEで登場。収集した素材を目当ての強化パーツへ交換する。
- ツメスパロボ
- D・Jに登場。指定された状況下から勝利条件の達成を目指す、パズル要素の強いミニゲーム。挑戦可能な面はシナリオ進行と共に増えていく。クリアすると初回のみ資金と強化パーツ（またはスキルパーツ）が手に入る。
- オプション / システム（メニュー）
- ゲーム設定を変更する。
- マッププレビュー
- 次のマップの地形と初期ユニット配置を確認する。登場はRなど一部作品のみ。
- 武器名変更
- D・J・W・Lに登場。主人公機の武器名を変更できる。Wではシステムの項目から選択する。
- 追加コンテンツ / ダウンロードリスト / ネットワーク
- ネットワークに接続しダウンロードコンテンツを利用する際の項目。
- それぞれ「追加コンテンツ」はUX、「ダウンロードリスト」はOE、「ネットワーク」は第3次Zでの名称。
- 次のマップへ
- インターミッションを終了させ、シナリオを進行させる。